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Ejemplos Script Slurm

Tarea: ejecutar programas utilizando gpu
Ejecución: sbatch submit_gpu_job.sh
Partición: gpu
Tiempo máximo: 3 días

                #!/bin/bash
 
                ### Las líneas #SBATCH configuran los recursos de la tarea
                ### (aunque parezcan estar comentadas)
 
                ### Nombre de la tarea
                #SBATCH --job-name=gpu_job
 
                ### Cola de trabajos a la cual enviar.
                #SBATCH --partition=gpu
                #SBATCH --gres=gpu:1
 
                ### Procesos a largar.
                ### Por defecto, se usa un solo proceso para tareas GPU.
                #SBATCH --ntasks-per-node=1
 
                ### Tiempo de ejecucion. Formato dias-horas:minutos.
                #SBATCH --time 3-0:00
 
                ### Script que se ejecuta al arrancar el trabajo
 
                ### Cargar el entorno del usuario incluyendo la funcionalidad de modules
                ### No tocar
                . /etc/profile
 
                ### Cargar los módulos para la tarea
                # FALTA: Agregar los módulos necesarios
                module load gcc
                module load cuda
                ### Largar el programa
                # FALTA: Cambiar el nombre del programa
                srun NOMBRE_DEL_PROGRAMA

Tarea: ejecutar programas utilizando mpi
Ejecución: sbatch submit_mpi_job.sh
Partición: batch
Tiempo máximo: 3 días

submit_mpi_job.sh

            #!/bin/bash
 
            ### Las líneas #SBATCH configuran los recursos de la tarea
            ### (aunque parezcan estar comentadas)
 
            ### Nombre de la tarea
            #SBATCH --job-name=mpi_job
 
            ### Tiempo de ejecucion. Formato dias-horas:minutos.
            #SBATCH --time 3-0:00
 
            ### Numero de procesos a ser lanzados.
            #SBATCH --ntasks=2
 
            ### Nombre de partcion
            #SBATCH --partition=batch
 
            ### Script que se ejecuta al arrancar el trabajo
 
            ### Cargar el entorno del usuario incluyendo la funcionalidad de modules
            ### No tocar
            . /etc/profile
 
            ### Cargar los módulos para la tarea
            # FALTA: Agregar los módulos necesarios
            module load gcc
            module load openmpi
 
            ### Largar el programa con los cores detectados
            ### La cantidad de nodos y cores se detecta automáticamente
            # FALTA: Cambiar el nombre del programa
            srun NOMBRE_DEL_PROGRAMA

Tarea: ejecutar programas utilizando OPENMP
Ejecución: sbatch openmp
Partición: batch
Tiempo máximo: 3 días

submit_openmp_job.sh

            #!/bin/bash
 
            ### Las líneas #SBATCH configuran los recursos de la tarea
            ### (aunque parezcan estar comentadas)
 
            ### Nombre de la tarea
            #SBATCH --job-name=openmp_job
 
            ### Cola de trabajos a la cual enviar.
            #SBATCH --partition=batch
 
            ### Procesos a largar.
            ### Es OpenMP, o sea que un proceso en un nodo y muchos hilos.
            #SBATCH --ntasks=1
 
            ### Hilos por proceso
            ### Poner el mismo valor acá que en OMP_NUM_THREADS/MKL_NUM_THREADS
            #SBATCH --cpus-per-task=56
 
            ### Tiempo de ejecucion. Formato dias-horas:minutos.
            #SBATCH --time 3-0:00
 
            ### Script que se ejecuta al arrancar el trabajo
 
            ### Cargar el entorno del usuario incluyendo la funcionalidad de modules
            ### No tocar
            . /etc/profile
 
            ### Configurar OpenMP/MKL/etc con la cantidad de cores detectada.
            export OMP_NUM_THREADS=56
            export MKL_NUM_THREADS=56
 
            ### Cargar los módulos para la tarea
            # FALTA: Agregar los módulos necesarios
            module load gcc
 
            ### Largar el programa
            # FALTA: Cambiar el nombre del programa
            srun NOMBRE_DEL_PROGRAMA