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wiki:licencias [2022/08/16 14:45]
srgualpa [Ejemplos Script Slurm]
wiki:licencias [2022/08/17 13:41] (actual)
srgualpa [Licencias]
Línea 894: Línea 894:
          
 </CSS> </CSS>
-======= SLURM =======+======= Licencias =======
                                        
 <HTML> <HTML>
-<!--  ------------------------------------------------------PARTE SLURM---------------------------------------------------------------------------- --> 
- 
-  <!-- <h1  id=""><div class="divSlurm">SLURM</div></h1>  --> 
- 
-     <div class="explicacionSlurm"> 
- 
-         <p><a href="https://slurm.schedmd.com/"> Slurm (Simple Linux Utility for Resource Management)</a> es un sistema de gestión de recursos en clusters de computadoras. Nos permite asignar los recursos computacionales (núcleos, memoria, gpu, etc.) de una forma equitativa a medida de su disposición. 
-         </p> 
- 
-    </div> 
-    <div class="recuadro">     
-        <br><h3><center>Entidades manejadas por los servicios de Slurm</center></h3> 
-        <p> 
-            <b>Nodos:</b>&nbsp;Sistema multiprocesador perteneciente al cluster<br><br> 
-            <b>Particiones:</b>&nbsp;es un mecanismo de agrupar en forma lógica los nodos. Sin importar el número de nodos que se disponen se puede crear la cantidad de particiones que uno desee. Un nodo puede pertenecer a varias particiones. Cada partición tiene sus propios parámetros: tiempo límite de trabajo, usuarios permitidos, que nodos la componen, etc. 
-            <br> <br>   
-              <b>Trabajos:</b>&nbsp;Un trabajo o job es la asignación de recursos a un usuario específico por una cantidad de tiempo determinada.<br><br> 
-            <b>Tareas:</b>&nbsp;Son el conjunto de programas (seriales o paralelas) que serán ejecutadas dentro de un trabajo.<br>  
-         </p> 
-    </div> 
-    <br> 
 <!--  ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --> <!--  ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -->
 +<p>Las licencias de software son un contrato de autorización sobre la obra entre el autor del programa y el usuario, en el cual definen con precisión los deberes de ambas partes. El autor tiene derecho intelectual exclusivo y concede a otros permisos utilizando licencias de software.</p>
  
-</HTML>     
-===== Modo uso de Slurm ===== 
-<HTML> 
-<!--  -----------------------------------------------------------Modo uso de Slurm  ----------------------------------------------------------------------- --> 
  
-     
-     
-    <div class="recuadro">     
-        <!-- <br><h3><center>Modo uso de Slurm</center></h3>--> 
-            <br> 
-            <p> 
-                Slurm proporciona una interfaz de usuario donde se pueden ejecutar comandos slurm desde el shell del sistema operativo.<br> 
-                El usuario envía los trabajos y Slurm se encarga de ubicarlo en la cola de espera. Si hay recursos pasa a ejecutar el trabajo.<br>En caso de estar ocupado el trabajo se ejecutará cuando estén disponibles los recursos. <br><br> 
-                En general, los pasos a seguir para ejecutar un trabajo son:<br> 
-            </p> 
-            <div  class="tipsVerde"> 
-                <br>  
-                <li1 value="1" class="textoVisible ">1. Analizar los recursos que dispone el cluster y las necesidades del trabajo. 
-                    <span class="textoOculto">Utilizar los comandos "sinfo" y "squeue". 
-                    </span> 
-                </li1> <br> <br>  
  
-                <li1 class="textoVisible1 ">2. Enviar el trabajo :   &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;             +  <!--   <p><a href="https://slurm.schedmd.com/"Licencias</ae. </p>-->
-                    <!-- <span class="textoOculto"> Existen dos opciones de envió: +
-                                               <br>Interactivamente utilizar "srun" y sus parámetros +
-                                                <br> Utilizar Script con el comando "sbatch" y sus parámetros. +
-                    </span>-->   +
-                    <li1 class="textoVisible ">A)&nbsp;Interactivamente                +
-                       <span class="textoOculto2"> Se utiliza "srun"  con los parámetros de configuración del trabajoEs una forma rápida de enviar el trabajo a ejecución, pero con varias restricciones.  +
-                        </span> +
-                    </li1 +
-                    <span>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; </span> +
-                    <li1 class="textoVisible ">B)&nbsp;Utilizar scripts.                 +
-                       <span class="textoOculto2"> Se debe crear un script con la configuración del trabajo. Usar "sbatch" y sus parámetros. +
-                        </span> +
-                    </li1>  +
-                </li1+
  
-                <br> +   
-                <br>  +
-                <li1 class="textoVisible  ">3. (Opcional) Verificar la correcta configuración. +
-                    <span class="textoOculto"> Utilizar el comando  "scontrol show job &ltJOBID&gt"+
-                    </span> +
-                </li1> <br> <br> +
  
-                <li1  class="textoVisible  ">4. (Opcional) Recuperar la información que resulta de la ejecución del trabajo. 
-                    <span class="textoOculto">Interactivamente: los resultados, errores, etc. se verán en el shell.<br> 
-                        Scripts: se guardan en un archivo  llamado slurm-&ltJOBID&gt.out 
- 
-                    </span> 
-                </li1> <br> <br>  
-            </div>  
- 
- 
- 
-    </div>     
     <br>     <br>
- <!-- <h3 >Comandos para ejecutar un trabajo</h3> --> 
 <!--  ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --> <!--  ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -->
  
-</HTML>      +</HTML>    
-===== Comandos para ejecutar un trabajo ===== +
-<HTML>  +
-     <!--  ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -->+
  
-     +=====Ejemplos de licencias de software=====
-    <button class="botonPanel"><b>SRUN:</b> envío de trabajo para ser ejecutado interactivamente</button> +
-    <div class="panel"> +
-            <br> +
-              <p><b>Envía el trabajo para ser ejecutado a Slurm. Si no posee recursos para el trabajo el shell queda esperando a que se desocupen. Si posee recursos ejecuta el programa y nos proporciona por la consola los resultados de la ejecución</b></p> +
-          <ul class="shell-body"   > +
-            <li style="color:greenyellow">[usuario@clemente ~]$ srun &ltNombrePrograma&gt </li> +
-        </ul> +
-         <p>&nbsp;</p> +
-        <p><b>Parámetros de srun</b></p> +
-        <p><b>-n, --ntasks:</b>&nbsp;especifica la cantidad de tareas para correr. Por default 1 tarea por 1 CPU.</p> +
-        <p><b>-j, --job-name:</b>&nbsp;especifica el nombre de la tarea</p> +
-        <p><b>-N, --nodes:</b>&nbsp;especifica el mínimo de nodos que deben ser reservado para el trabajo</p> +
-        <p><b>-p, --partition:</b>&nbsp;especifica la partición donde el trabajo se va a ejecutar.</p> +
-        <p><b>-v -vv -vvv :</b>&nbsp;Aumenta el nivel de verbosidad.</p> +
-        <p><b>-o &ltArchivoSalida&gt:</b>&nbsp;Redirecciona la salida al archivo especificado.</p> +
-         +
-        <br><br><h4>Ejemplos srun</h4> +
-        <br> +
-        <ul class="shell-body"> +
-            <li style="color:greenyellow">[usuario@clemente ~]$ srun -n 2 miPrograma</li> +
-        </ul><br> +
-        <p>Ejecuta miPrograma en 2 tareas, cada una en diferentes CPUs </p> +
-        <br> +
-        <ul class="shell-body"> +
-            <li style="color:greenyellow">[usuario@clemente ~]$ srun -n 6 --tasks-per-node=3 --partition=debug  miPrograma</li> +
-        </ul><br> +
-        <p>Ejecuta miPrograma en 6 tareas distribuida en dos nodos, en la partición debug. </p> +
-        <br><br> +
-         +
-    </div> +
-     +
-    <button class="botonPanel"><b>SBATCH:</b> envío de un script de trabajo al sistema de cola de espera slurm</button> +
-    <div class="panel"> +
-             <br> +
-              <p><b>SBATCH es la forma más adecuada de ejecutar un trabajo. Se utiliza un archivo script para la configuración de Slurm y del sistema operativo para ejecutar el trabajo. </b></p> +
-          <ul class="shell-body"> +
-            <li style="color:greenyellow">[usuario@clemente ~]$ srun &ltNombreScriptSlurm&gt </li> +
-        </ul> +
-         <p>&nbsp;</p> +
-        <p><b>Parámetros de sbatch</b></p> +
-        <p><b>-n, --ntasks:</b>&nbsp;especifica la cantidad de tareas (procesos) para correr</p> +
-        <p><b>-j, --job-name:</b>&nbsp;especifica el nombre de la tarea</p> +
-        <p><b>-N, --nodes:</b>&nbsp;especifica el mínimo de nodos que deben ser reservado para el trabajo</p> +
-        <p><b>-p, --partition:</b>&nbsp;especifica la partición donde el trabajo se va a ejecutar.</p> +
-         <p><b>--mail-user &ltemail&gt--mail-type=ALL:&nbsp; </b>Envía un mail notificando el cambio de estado en el trabajo</p> +
- +
- +
-        <br><br><h4>Ejemplos sbatch</h4> +
-        <br> +
-        <ul class="shell-body"> +
-            <li style="color:greenyellow">[usuario@clemente ~]$ sbatch -N2 --name=&ltnombre&gt&nbsp;&nbsp;--mail-user= &ltemail@address.com&gt&nbsp;&nbsp;--mail-type=ALL &ltNombreScriptSlurm&gt /li> +
-        </ul><br> +
-        <p>Ejecuta el script NombreScriptSlurm  en 2 nodos y enviá mail por cambios de estados</p> +
-        <br> +
-        <ul class="shell-body"> +
-            <li style="color:greenyellow">[usuario@clemente ~]$ sbatch -N3 --time=60</li> +
-        </ul><br> +
-        <p>Ejecuta el script NombreScriptSlurm  en 3 nodos y como limite máximo de tiempo  1 hora . </p> +
-        <br><br> +
-        <p><i>Para más información ver la sección "Script de lanzamientos y comandos SBATCH".</i> </p> +
- +
-         +
-    </div> +
-    <br> +
-    <br> +
-    <br> +
- <!--  ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --> +
-</HTML>   +
-     +
- +
-=====Ejemplos Script Slurm=====+
 <HTML>    <HTML>   
          <!--  ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -->          <!--  ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -->
  
-<button class="botonPanel"  >Scripts Slurm Clemente</button> + 
-<div class="panel"> +     <button class="botonPanel"  >MIT</button>
-     <button class="botonPanel"  >GPU</button>+
      <div class="panel">      <div class="panel">
          <br>          <br>
          <ul class="ul1">          <ul class="ul1">
-            <li class="li1">Tarea: ejecutar programas utilizando gpu </li> +            <li class="li1"> </li> 
-            <li class="li1">Ejecuciónsbatch submit_gpu_job.sh </li> +            <li class="li1">Wikipediahttps://es.wikipedia.org/wiki/Licencia_MIT </li> 
-            <li class="li1">Particióngpu </li> +            <li class="li1">CopyleftNO </li> 
-            <li class="li1">Tiempo máximo: 3 días </li>+            <li class="li1">Utilizable con otras licencias</li>
  
          </ul>              </ul>    
          <br>          <br>
 </HTML>          </HTML>         
-        <file c submit_gpu_job.sh[enable_line_numbers="true",highlight_lines_extra="7,10,11,14,17,28,32"]> +        <file txt LICENSE[enable_line_numbers="true",highlight_lines_extra="11,12,13,14,15,16,17"]> 
-                #!/bin/bash+               MIT License
  
-                ### Las líneas #SBATCH configuran los recursos de la tarea +Copyright (c<YEAR> <COPYRIGHT HOLDER>
-                ### (aunque parezcan estar comentadas)+
  
-                ### Nombre de la tarea +Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy 
-                #SBATCH --job-name=gpu_job+of this software and associated documentation files (the "Software"), to deal 
 +in the Software without restriction, including without limitation the rights 
 +to use, copy, modify, merge, publish, distribute, sublicense, and/or sell 
 +copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is 
 +furnished to do so, subject to the following conditions:
  
-                ### Cola de trabajos a la cual enviar. +The above copyright notice and this permission notice shall be included in all 
-                #SBATCH --partition=gpu +copies or substantial portions of the Software.
-                #SBATCH --gres=gpu:1+
  
-                ### Procesos a largar. +THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR 
-                ### Por defectose usa un solo proceso para tareas GPU. +IMPLIED, INCLUDING BUT NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY
-                #SBATCH --ntasks-per-node=1 +FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND NONINFRINGEMENTIN NO EVENT SHALL THE 
- +AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM, DAMAGES OR OTHER 
-                ### Tiempo de ejecucion. Formato dias-horas:minutos+LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM, 
-                #SBATCH --time 3-0:00 +OUT OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN THE 
- +SOFTWARE.
-                ### Script que se ejecuta al arrancar el trabajo +
- +
-                ### Cargar el entorno del usuario incluyendo la funcionalidad de modules +
-                ### No tocar +
-                /etc/profile +
- +
-                ### Cargar los módulos para la tarea +
-                # FALTA: Agregar los módulos necesarios +
-                module load gcc +
-                module load cuda +
-                ### Largar el programa +
-                # FALTA: Cambiar el nombre del programa +
-                srun NOMBRE_DEL_PROGRAMA+
         </file>         </file>
 <HTML>  <HTML> 
Línea 1115: Línea 958:
          <br>          <br>
          <ul class="ul1">          <ul class="ul1">
-            <li class="li1">Tareaejecutar programas utilizando mpi </li> +            <li class="li1">Wikipedia: https://es.wikipedia.org/wiki/Licencia_BSD </li> 
-            <li class="li1">Ejecución: sbatch submit_mpi_job.sh </li> +            <li class="li1">CopyleftNO </li> 
-            <li class="li1">Particiónbatch </li> +            <li class="li1">Utilizable con otras licencias</li>
-            <li class="li1">Tiempo máximo: 3 días  </li>+
          </ul>              </ul>    
          <br>          <br>
Línea 1125: Línea 967:
 BSD 3-Clause License BSD 3-Clause License
  
-Copyright (c) 2022, varios_iate+Copyright (c) <YEAR> <COPYRIGHT HOLDER>
 All rights reserved. All rights reserved.
  
Línea 1155: Línea 997:
 <HTML>   <HTML>  
     </div>     </div>
-     
-    <button class="botonPanel"  >Unlicense</button> 
-     <div class="panel"> 
-         <br> 
-         <ul class="ul1"> 
-            <li class="li1">Tarea: ejecutar programas utilizando OPENMP </li> 
-            <li class="li1">Ejecución: sbatch openmp </li> 
-            <li class="li1">Partición: batch </li> 
-            <li class="li1">Tiempo máximo: 3 días </li> 
-         </ul>     
-         <br> 
-</HTML>          
-        <file c LICENSE[enable_line_numbers="true",highlight_lines_extra="1,3,4,5,6,16,17,18,19,20"]> 
-This is free and unencumbered software released into the public domain. 
  
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-distribute this software, either in source code form or as a compiled 
-binary, for any purpose, commercial or non-commercial, and by any 
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-EXPRESS OR IMPLIED, INCLUDING BUT NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF 
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-OTHER LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, 
-ARISING FROM, OUT OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR 
-OTHER DEALINGS IN THE SOFTWARE. 
- 
-For more information, please refer to <https://unlicense.org> 
-        </file> 
-<HTML> 
-    </div> 
          
          
Línea 1203: Línea 1006:
     </div>     </div>
  
-     +
-    </div>+
     <br>               <br>          
     <br>               <br>          
wiki/licencias.1660661112.txt.gz · Última modificación: 2022/08/16 14:45 por srgualpa