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wiki:tutorial_module

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wiki:tutorial_module [2019/08/06 16:05]
admin [Comandos Environment Modules]
wiki:tutorial_module [2019/08/06 18:13] (current)
admin [Environment Modules]
Line 183: Line 183:
     </p>     </p>
  
-    En el cluster Clemente, los modulos se encuentran organizados por niveles:<​br><​br>​ + 
-  <​b>​1)</​b>​ Según la arquitectura del procesador.<​br>​ +
-  <​b>​2)</​b>​ Según la aplicación o compiladores.<​br><​br>​ +
-   <​br>​ +
-  <​i><​tips class="​tips">​Tips:​ Al iniciar en Clemente el primer módulo que se debe cargar es aquel que indica arquitectura.</​tips></​i><​br><​br>​+
 <br> <br>
 </​HTML> ​               ​ </​HTML> ​               ​
Line 214: Line 210:
         <li style="​color:​greenyellow">​------------------------- /​opt/​modules/​compiladores-------------------------</​li>​         <li style="​color:​greenyellow">​------------------------- /​opt/​modules/​compiladores-------------------------</​li>​
         <li style="​color:​greenyellow">​cuda/​8&​nbsp;&​nbsp;&​nbsp;​gcc/​7&​nbsp;&​nbsp;&​nbsp;​gcc/​8.2.0</​li>​         <li style="​color:​greenyellow">​cuda/​8&​nbsp;&​nbsp;&​nbsp;​gcc/​7&​nbsp;&​nbsp;&​nbsp;​gcc/​8.2.0</​li>​
-        <li style="​color:​greenyellow">​ </​li>​ +        <li style="​color:​greenyellow">​&nbsp;</​li>​ 
-        <li style="​color:​greenyellow">​--------------------- /​opt/​modules/​gcc/​8/​bibliotecas ---------------------</​li>​+        <li style="​color:​greenyellow">​----------------------- /​opt/​modules/​gcc/​8/​bibliotecas ---------------------</​li>​
         <li style="​color:​greenyellow">​cfitsio/​3.450&​nbsp;&​nbsp;​fftw/​3.3.8&​nbsp;&​nbsp;​hdf5/​1.8.12&​nbsp;&​nbsp;​hypre/​2.15.1 &​nbsp;&​nbsp;​zlib/​1.2.11 ​ </li>         <li style="​color:​greenyellow">​cfitsio/​3.450&​nbsp;&​nbsp;​fftw/​3.3.8&​nbsp;&​nbsp;​hdf5/​1.8.12&​nbsp;&​nbsp;​hypre/​2.15.1 &​nbsp;&​nbsp;​zlib/​1.2.11 ​ </li>
-        ​<li style="​color:​greenyellow"> ​</​li>​ +                        ​<li style="​color:​greenyellow">&​nbsp</​li>​
-        <li style="​color:​greenyellow">​----------------------------- ​ /​opt/​modules/​clemente/​gcc/​7/​aplicaciones ​ -----------------------------</​li>​ +
-        <li style="​color:​greenyellow">​anaconda2/​5.0.0&​nbsp;&​nbsp;​casa/​5.1.2&​nbsp;&​nbsp;​gadget/​2&​nbsp;&​nbsp;​im2shape/​2&​nbsp;&​nbsp;​psfex/​3.17.1&​nbsp;&​nbsp;​sextractor/​2.19.5</​li>​ +
-        <li style="​color:​greenyellow">​anaconda3/​5.0.0&​nbsp;&​nbsp;​flash/​4.4&​nbsp;&​nbsp;​galsim/​1.6&​nbsp;&​nbsp;​im3shape/​3&​nbsp;​&nbsp;​python/​2.7.14 ​</li>+
  
 +        <li style="​color:​greenyellow">​fftw&​nbsp;&​nbsp;&​nbsp;&​nbsp;&​nbsp;&​nbsp;&​nbsp;&​nbsp;&​nbsp;&​nbsp;&​nbsp;​gsl/​2.5&​nbsp;&​nbsp;&​nbsp;&​nbsp;&​nbsp;​hdf5/​1.10.5&​nbsp;&​nbsp;​openblas/​0.3.5&​nbsp;&​nbsp;</​li>​
 +        <li style="​color:​greenyellow">&​nbsp</​li>​
 +        <li style="​color:​greenyellow">​------------------------- ​ /​opt/​modules/​gcc/​8/​herramientas ------------------</​li>​
 +        <li style="​color:​greenyellow">​cmake/​3.13.4</​li>​
 +                <li style="​color:​greenyellow">&​nbsp</​li>​
 +        <li style="​color:​greenyellow">​------------------------- ​ /​opt/​modules/​gcc/​8/​mpi ---------------------------</​li>​
 +        <li style="​color:​greenyellow">​openmpi/​3.1.3</​li>​
 +         <​li style="​color:​greenyellow">&​nbsp;</​li>​
 +                <li style="​color:​greenyellow">​------------------------- ​ /​opt/​modules/​gcc/​8/​sistema -----------------------</​li>​
 +        <li style="​color:​greenyellow">​python/​2.7.16</​li> ​
 +        ​
 + <​li style="​color:​greenyellow">&​nbsp;</​li>​
       </ul>       </ul>
     <​p><​br>​Para ver que módulos tenemos cargados actualmente en nuestro entorno <comando class="​textoEspecial"><​i>"​module list"</​i></​comando>​     <​p><​br>​Para ver que módulos tenemos cargados actualmente en nuestro entorno <comando class="​textoEspecial"><​i>"​module list"</​i></​comando>​
Line 227: Line 232:
         </p>         </p>
       <ul class="​shell-body">​       <ul class="​shell-body">​
-        <li style="​color:​greenyellow">​[usuario@clemente ~]$ module load gcc/7</li>+        <li style="​color:​greenyellow">​[usuario@clemente ~]$ module load openmpi/3.1.3</li>
         <li style="​color:​greenyellow">​[usuario@clemente ~]$ module list</​li>​         <li style="​color:​greenyellow">​[usuario@clemente ~]$ module list</​li>​
         <li style="​color:​greenyellow">&​nbsp;</​li>​         <li style="​color:​greenyellow">&​nbsp;</​li>​
         <li style="​color:​greenyellow">​Currently Loaded Modulefiles:</​li>​         <li style="​color:​greenyellow">​Currently Loaded Modulefiles:</​li>​
-        <li style="​color:​greenyellow">&​nbsp;​1)&​nbsp;​clemente&​nbsp;&​nbsp;​2)&​nbsp;/​opt/​modules/​clemente/​gcc/​7/​sistema/​libgcc/​7&​nbsp;&​nbsp;​3)&​nbsp;​gcc/​7 ​</li>+        <li style="​color:​greenyellow">&​nbsp;​1)&​nbsp;​gcc/8.2.0&​nbsp;&​nbsp;​2)&​nbsp;​openmpi/3.1.3 </li>
       </ul>       </ul>
     <br>     <br>
Line 238: Line 243:
    <​p>​Si se cargan módulos incompatibles,​ modules avisará</​p>​    <​p>​Si se cargan módulos incompatibles,​ modules avisará</​p>​
     <ul class="​shell-body">​     <ul class="​shell-body">​
-        <li style="​color:​greenyellow">​[usuario@clemente ~]$ module load clemente</​li>​ +        <li style="​color:​greenyellow">​[usuario@clemente ~]$ module load gcc/7</​li>​ 
-        <li style="​color:​greenyellow">​[usuario@clemente ~]$ module load mirta3</li>+        <li style="​color:​greenyellow">​[usuario@clemente ~]$ module load gcc/8.2.0</li>
         <li style="​color:​greenyellow">&​nbsp;</​li>​         <li style="​color:​greenyellow">&​nbsp;</​li>​
-        <li style="​color:​greenyellow">​WARNING: ​mirta3 ​cannot be loaded due to a conflict.</​li>​ +        <li style="​color:​greenyellow">​WARNING: ​gcc/​8.2.0 ​cannot be loaded due to a conflict.</​li>​ 
-        <li style="​color:​greenyellow">​HINT:​ Might try "​module unload ​clemente" first.</​li>​+        <li style="​color:​greenyellow">​HINT:​ Might try "​module unload ​gcc/7" first.</​li>​
       </​ul><​br>​       </​ul><​br>​
  
Line 270: Line 275:
     </p>     </p>
     <ul class="​shell-body">​     <ul class="​shell-body">​
-        <li style="​color:​greenyellow">​[usuario@clemente ~]$ module whatis ​intel/2018</li>+        <li style="​color:​greenyellow">​[usuario@clemente ~]$ module whatis ​gcc77</li>
         <li style="​color:​greenyellow">&​nbsp;</​li>​         <li style="​color:​greenyellow">&​nbsp;</​li>​
-        <li style="​color:​greenyellow">​ ---------------------- /​opt/​modules/clemente/​compiladores ----------------------</​li>​ +        <li style="​color:​greenyellow">​ ---------------------- /​opt/​modules/​compiladores ----------------------</​li>​ 
-        <li style="​color:​greenyellow">&​nbsp;&​nbsp;&​nbsp;&​nbsp;&​nbsp;&​nbsp;&​nbsp;&​nbsp; ​intel/2018: icc/​icpc/​ifort 16.0.4</li>+        <li style="​color:​greenyellow">&​nbsp;&​nbsp;&​nbsp;&​nbsp;&​nbsp;&​nbsp;​gcc/7:&​nbsp; ​The&nbsp;GNU&​nbsp;​Compiler&​nbsp;​Collection&​nbsp;​includes&​nbsp;​front&​nbsp;​ends&​nbsp;​for&​nbsp;​C,&​nbsp;​C++,​ &​nbsp;​Objective-C,&​nbsp;​Fortran,&​nbsp;​Ada,​ &​nbsp;​and&​nbsp;​Go,&​nbsp;​ as&​nbsp;​well&​nbsp;​ as libraries&​nbsp;​ for&​nbsp;​these&​nbsp;​languages.</​li>​
     </ul>     </ul>
         <​br><​br>​         <​br><​br>​
wiki/tutorial_module.1565107546.txt.gz · Last modified: 2019/08/06 16:05 by admin